Молекулярная динамика — это компьютерный метод, позволяющий моделировать движение атомов и молекул, учитывая их взаимодействия в течение заданного времени. Система фиксирует положение и скорость каждой частицы, вычисляет действующие силы и предсказывает будущие состояния. Метод опирается на классические уравнения движения Ньютона и различные численные алгоритмы, которые помогают смоделировать поведение многочастичных систем.